מגמת רפואה בתיכון אורט כרמי גת היא מגמה ייחודית בעיר. תלמידי המגמה לומדים ביולוגיה או פיסיקה ומתמחים במקצועות הבריאות.
במסגרת הלימודים במגמה הם פוגשים אנשי מקצוע, מבקרים בבית חולים ומקבלים הסברים על המחלקות השונות, מבקרים בטכנודע- מוזיאון ייחודי בחדרה לרפואה ושם עורכים פעילויות שונות אשר מחדדות את הלמידה. גם ניתוח לב היה במגמה – התלמידים ניתחו לבבות חזירים (המבנה האנטומי שלו הוא הקרוב ביותר ללב האנושי) וההתרגשות הייתה רבה.
במגמה מכשירים את אנשי הרפואה העתידיים בכלים פדגוגיים מגוונים ולמידה מאתגרת וחדשנית.